1964年，美国纽约布朗克斯圣尼古拉斯天主教学校。 阿洛伊修斯·贝维尔修女（梅丽尔·斯特里普饰）性格压抑、严厉，深受学生们的畏惧。 而新来的神父布伦丹·弗林（菲利普·塞默·霍夫曼 Philip Seymour Hoffman 饰）心地善良、思想开放，深受学生们的喜爱。 在此期间，弗林特别关心学校历史上第一位黑人学生唐纳德·米勒（约瑟夫·福斯特饰）。 有一天，詹姆斯修女（艾米·亚当斯饰）将唐纳德的奇怪启示告诉了贝维尔修女。 贝维尔认为弗林正在与一名男孩发展不适当的关系，她决心不惜一切代价阻止这种关系。 但事实是怎样的呢？
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