蚂蚁小子佩尔在打败了他的宿敌弗利亚后比以往任何时候都更受欢迎，弗利亚现在被关在一家研究所里。 佩尔一转眼就满13岁了，他已经习惯了当超级英雄。 在理想的世界里，佩尔的搭档艾达应该是他的女朋友，但现实很复杂。 艾达现在有了一个意想不到的对手，一个在学校独自生活的小男孩。 他不仅不断阻止艾达接近佩尔，而且还是比弗利更强大的对手。 更可怕的是，佩尔逐渐发现自己被操纵了，现在他却遇到了新的、更强大的敌人。 敌人具有隐形能力，难以揣测，这常常给他带来麻烦。 此时，一位超级大反派的到来也宣告到来，佩尔面临着前所未有的挑战。
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