高级特工伊森·亨特（汤姆·克鲁斯饰）也经历过一段孤独的时刻。 当他接到最新的工作时，却遭到神秘组织“辛迪加”的暗算，落入对手手中。 该辛迪加是一个由来自世界各地的前特工组成的秘密组织，之前一直被中央情报局视为毫无根据。 在对方成员伊莎·福斯特（丽贝卡·弗格森饰）的帮助下，伊森逃脱并及时向威廉·布拉德（杰瑞米·雷纳饰）报告了辛迪加的确切存在。 然而，布莱德此时的日子并不好过。 他控制的IMF机构因俄罗斯核弹头等问题遭到中央情报局指控并勒令解散。 当得知该组织密谋刺杀奥地利总统时，伊森联系老搭档本吉·邓恩（西蒙·佩吉 Simon Pegg 饰）发起行动，并再次遇见了神秘女孩伊莎。 在接下来的一系列事件中，辛迪加的真面目逐渐被揭开，他们的真正目的也终于显露出来……
