明治维新时期，敌我双方为了各自的理想和目标进行了英勇的战斗。 这一时期，名人和志士不断涌现：大久保利通、木户隆良、坂本龙马、冲田总司等。 为了刺激新时代的到来，维新派不惜使用暗杀手段，飞村剑心就是众多暗杀者之一。 出生为孤儿的黑村，从征十郎彦那里学习了飞剑术。 他下山参战，年轻气盛，在奇兵队伍中崭露头角。 飞村凭借自己独特的能力，最终成为令幕府闻风丧胆的刽子手拔刀斋。 与此同时，他还与宿敌壬生狼齐藤一进行了无数次的对决。 明治政府发现后，灰村收起了屠刀，腰间挂着一把反刃剑，变成了浪人。 途中，他结识了神谷道场继承人薰、东京都贵族后裔明神弥彦、前红新闻组成员相良左之介。 一次又一次的战斗中，他们的友谊不断加深，非村沾满血迹的心也慢慢得到净化。 本片改编自同名漫画。
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