三国时期，战争爆发。年轻的华佗为家乡亳州的百姓治病救治，过着洒脱的生活。华佗灵巧的手使太守的女儿明心起死回生，获得了神医的美誉。为了研制麻非散给明心治疗眼睛，华佗开始四处游历寻药。在京城，华佗与英雄关羽、汉奸曹操和他的师兄吴思德频繁相遇，看到了阴森的官场和灼热的世界。最让华佗伤心的是，心爱的少女明心被吴思德悲惨地占据了。东吴山中，绝望的华佗得到隐士的指点，顿时清醒过来，立志成为医治人心、医治国度的大医。赤壁之战，刮骨解毒，秘境冒险。任凭风吹雨打，不曾改变拯救苍生的纯洁之心。马飞散的研制成功，也让华佗与明心的爱情成真，但幸福来临时，曹操却因病、疑、恨而俘获了华佗。死于狱中。
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