前人类与普通人类之间的种族战争已经到了白热化的阶段。 领袖野野村去世后，吉川（北村一树饰）、佐绫当麻（户田惠梨香饰）和芬龙濑文美（加濑凉饰）等人聚集在不详的总部，苦苦思索J教授的真实身份。 不料，正当当麻查明真相时，警察医院的成人和儿童SPEC持有者惨遭屠杀。 愤怒的当麻无法压制封印在体内的SPEC。 她狂奔，出现在帝王会议上。 在犹大、世海（向井里 饰）、纯（大岛优子 饰）的见证下，法蒂玛的第三个预言实现了。 一朵缩小而耀眼的蘑菇云在天空中升起，成千上万的八尺黑影遮蔽了天空，被欲望和毒害主宰的世界迎来了毁灭的时刻。 命运的交汇处，头麻和芬流能否阻止世界的灭亡？
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