故事发生在明朝末年。 将军戚继光与兵部尚书戚继瑜联合组建戚家军，专门打击敢于侵犯我国的倭寇。 海盗头目大岛正夫与太监佟大宝（于成辉饰）内外勾结陷害齐济宇，导致齐家军解散。 齐家被屠杀。 作为齐家唯一的后裔，齐绍正（吴京饰）不得不踏上了流亡之旅。 少林寺方丈智一（王珏饰）收齐绍正为徒。 佟大宝得知戚少正的下落，烧毁了少林寺。 知一为了保护齐绍正而死。 随后，齐绍正带着智一的血信前往南少林投靠方丈圆照（徐向东饰），并先后结识了小妮（法蒂玛雅琪饰）、红莲、花子等人。 一群朝气蓬勃的年轻人计划凭借自己的力量重建齐家军队。
