本片拍摄于1989年，是1986年版本的续集。 影片延续了第一集的伏笔，母亲维尼卡怀上了塞斯的孩子。 当她生出蝇蛹时，当场被吓死。 政府科研机构巴托工业园收养了苍蝇之子马丁·布隆多（埃里克·斯托尔兹 Eric Stoltz 饰），并由巴托工业老板巴托先生（约翰·盖兹 John Getz 饰）抚养长大。 巴托先生密切监视着马丁的一举一动。 表面上，他视马丁为自己的儿子，但实际上，他把他当作研究对象。 他用摄像机秘密记录了自己的所有生命过程，并让马丁研究了父亲生前使用的时空传输装置。 。 马丁长得英俊潇洒，与常人无异，除了惊人的成长速度和超人的天赋。 很快，马丁爱上了美丽的贝丝·洛根（达芙妮·祖尼加 Daphne Zuniga 饰）。 但隐藏在马丁体内的变异染色体却突然觉醒，等待马丁的，是成为下一个“飞人”的可怕消息。
